
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科研报告
理论研究员工探究性学习随着时候的推移保温时候不断提升牛羊肉的强度、持来说水力、色度、徘徊铁含氧量、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4平均水平来评估报告格式腹肌安排癌神经元的铁消失形态。结杲体现 ,保温时候不断提升后,牛羊肉的强度在第8天和第6天差异性下滑;持水学习能力大幅度降低;配色变深,逐渐耗尽金属光泽,鲜灰色变的暗灰色。不仅如此,徘徊铁、渗透性氧和MDA的含氧量差异性提升,癌神经元凋亡率差异性提高。 研究进行深入分析人士生成的有所各种不同冷冻箱周期的肌肤合格品的蛋清酶质,然后呢实行SDS-PAGE进行深入分析,蛋清酶质条带在的有所各种不同十六国时期布置不均且类似于(图1a)。按照其蛋清酶在的有所各种不同合格品中的理解状态,进行深入分析找到一致组合格品的中四位数介于于一致横向(图1b),代表肌肤合格品蛋清酶质有着优良的组内类似于性和组间差异聊天性。 淀粉酶质组学共检测费出1996种淀粉酶质。以B0为较组,需求B1、B2、B4和B6中的淀粉酶确定差别表述定量进行分析,共检测费到376个DEPs。将火山图可视化数据,并不断地FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05一个规则定量进行分析DEP。最终如图如下图所示1c-f如下图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别检测费出22、33、73和140个DEPs,进来分刘海别上浮6、11、32和815个,下跌16、22、41和5二个。聚类算法技术评估方法了有所对比分析保温时段脂肪组织安排中淀粉酶质的表述,最终表示脂肪淀粉酶表述差别不断地补充精力的上升而上升(图1g)。
图1| 不相同冷藏箱期限的手臂肌肉样机蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有差异性 冷冻时候的手臂肌肉样品管理差异性蛋白酶数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁阵亡蛋白质肽的PRM定量了解了解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 根据KEGG含有异同表达爱蛋清的铁死亡者逻辑(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物学提供了TMT一定量核淀粉酶质含量组学技術工艺商品,拜谱生物体已科研已完成并加入了加强制度建设熟的转录组学、核淀粉酶组学、新陈代谢组学及其多个学携手商品技術工艺商品体系中,欢迎致电咨询!
参照文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.