
近日,广州医科读书1、附带医院专家王学浩中科院院士人员在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法电量分解检测分析服务。
英文音标版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
汉语宝贝标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
雇主企业:南京医科大学
探析的材料:细胞
拜谱保证服务保障:转录组测序+核蛋白互作组+靶向药物卡路里排泄组
系统的路线:
科学研究报告单
01、YBX1被认定为HCC中糖酵解的首要人类基因
本深入探讨终端采集HCC癌肿样表(n=7)的单受损细胞核膜RNA测序动态参数集参与探讨,遇到糖酵解催化活性主要是集中化在癌肿受损细胞核膜中,hdWGCNA探讨判断出9个染色体控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的求生活工作探讨知道YBX1为独特求生活工作危险 影响因素(图1H)。进步构建IHC、WB实验操作和癌肿机构与挨近非癌肿机构的室内空间转录组学动态参数集核实YBX1是肝受损细胞核膜癌控制的因素靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被决定为可以调节HCC上皮细胞糖酵解的重点情况
02、YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点势能新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1运用并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化资料其磷酸性反应,然而有助于其核转位
进一次测量YBX1的O-GlcNAc糖基化有无导致其磷过酸,在OGT敲低的HCC血细胞核中或用OGT控药物OSMI-1操作,YBX1血清横向可观较低,YBX1磷过酸可观以减少(图4A-C)。IP科学试验展示,在同一的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷过酸横向可观超过YBX1-T57A,显示磷过酸的曾加不仅能仅是原因分析极高的YBX1血清呈现(图4D)。提取了核和质混合物出现 TMG操作的HCC血细胞核中YBX1核呈现的提高(图4E-F),进一次出现 YBX1磷过酸的最为关键的调节器细胞是AKT(图4G-I)。这种出现 注重O-GlcNAc糖基化顺利通过有利于其磷过酸来怎强YBX1血清安稳性并有利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖有助于于其进一点引发磷硝化作用遮盖并可以使得其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1使得PKM2转录
06、YBX1 可增强组血清乳硝化作用表达质量
钻研知道YBX1敲低相关系数较低淀粉酶质乳过酸,需要是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解促使剂2-DG的研究否认了糖酵解与组淀粉酶乳过酸的之间联系,促使糖酵解可相关系数较低H3K18la级别(图6D)。PKM2过描述不可逆转转YBX1敲低而致的H3K18la下滑,到外源乳酸加工这样不仅发展H3K18la,还触发YBX1描述调涨,的提示存在着领域反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR否认,H3K18la依据含有于YBX1打火子之间改善其转录,该流程受O-GlcNAc糖基化调空(图6H-J),并知道P300 调涨是YBX1改善H3K18乳酰凝成用的机理(图6K-L)。
图6.YBX1强化H3K18乳硝化作用掩盖层次
本文总结
在在这种钻研中新闻稿件了YBX1在HCC中高描述,并与糖酵解秘切有关系。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,为了平衡核氨基酸并提高其描述。在这种绘制还使得YBX1在T57处的磷碱化,使得其核易位。但是,某些方式促进了糖酵解有关系表观遗传的转录并有趣乳酸的生成。还有就是,YBX1激活卡P300的转录,因此驱动包组核淀粉酶的乳碱化,特别是H3K18la,H3K18乳碱化同向调空YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正负极馈环体制图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶点消耗的能量新陈代谢组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、反译后淡化组学、分解组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合论文毕业论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.