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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 手机网络药剂学学论述草酸钙肾结石氧化反应应激状态和支原体感染影响长效机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿软件软件系统通常見的病毒一个。肾团队中CaOx硫化锌过是处于饱和状态积累会会从而导致肾小管细胞系损坏和凋亡,而会从而导致肾结石的建成。短链肌肉堆积酸由肠子内活性污泥微生物发酵法营养饮食玻璃纤维所产生,不单在部分区域肠子防线中挥发能力,另一方面在软件软件系统水平面上也挥发要素能力。另外,丁酸是最丰富多彩的短链肌肉堆积酸,具备着消除炎症和天然免疫减弱能力,本科研初探丁酸对CaOx肾结石的能力简答未知靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山专科医院泌尿急诊科吴忠副教授、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健博士后在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了数据网络药学学服务质量,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

散文简称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 朋友政府部门:华山医阮 研发因素:大鼠、HK-2人体细胞 分组名称数据信息:差表组(Con)、建模组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱展示 技巧:无线网络药剂学学检查

策略操作流程图

实验结论

科研技术人员应先引入大鼠实体三维整治,采用生理方面生物化指标体系和阻止病症学复染等科研措施知道丁酸能少CaOx实体三维整治大鼠肾CaOx结晶的构成和挤压伤,有效改善CaOx实体三维整治大鼠的感染挤压伤和阳极钝化产品的频繁表现。虽然,丁酸还可压制草酸引诱的HK-2上皮细胞系挤压伤、阳极钝化应激反应和上皮细胞系凋亡。 为理论研究性学习丁酸格局和靶人类遗传遗传人类人类DNA遗传网格,理论研究人数从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和三维立体格局(图1A)。能够PharmMapper数据文件信息表格库和Uniprot数据文件信息表格库治理 后共建立出116个丁酸靶人类遗传遗传人类人类DNA遗传供进几步解析。将人类遗传遗传人类人类DNA遗传列表页导成STRING数据文件信息表格库,开始PPI网格解析。Cytoscape给定了排列的前20的交通联络线靶人类遗传遗传人类人类DNA遗传的详实网格图,涵盖CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。等交通联络线人类遗传遗传人类人类DNA遗传与网格中的的人类遗传遗传人类人类DNA遗传均表現出相应的极为重要性性性,解释等人类遗传遗传人类人类DNA遗传或者会表现着协同工作的功效。GO和KEGG解析蕴含了丁酸交通联络线人类遗传遗传人类人类DNA遗传的极为重要性性经过和菌物学用途(图1C)。交通联络线人类遗传遗传人类人类DNA遗传核心与类固醇缴素初次对答、被阳极氧化应激性生理响应初次对答、特异性氧细胞核对类固醇缴素兴奋的生理响应包括对弱酸性生物工程学材质的生理响应有关系。总而言之所写,等交通联络线人类遗传遗传人类人类DNA遗传核心通过了被阳极氧化应激性生理响应和对特异性氧的菌物生理响应进程,是肾结石变成制度化中不可或缺性的经过,这反映出丁酸或者会在肾结石中表现极为重要性的功效。

图1| 丁酸空间结构与靶基因组网路定性分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进三步探索性丁酸对CaOx肾结石实际上切靶什么是表观遗传,钻研工人再生利用GEO大sql数据文件对GSE73680中卫生剖析与CaOx肾结石病员的什么是表观遗传区别实行了钻研。剖析组与CaOx结石病员的取得性区别表答什么是表观遗传(DEGs)肿瘤筛查标准化为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个什么是表观遗传再次发生取得变,另外3379个(89.4%)什么是表观遗传表答上涨,404个(10.6%)什么是表观遗传表答再降(图2A)。对DEGs实行聚类算法算法分折,热图显视了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类算法算法的特点(图2B)。最后,钻研工人经过GeneCards大sql数据文件人力检测了370个也许 与CaOx肾结石有关系的什么是表观遗传,的排名前20位的预测分析什么是表观遗传还有其有关系性评定右图2C如下。考虑到找到了丁酸缓解CaOx肾结石的首要靶点,钻研工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系什么是表观遗传来进行处理收获新一个Venn图。终究,CYP2C9被制定为丁酸影响到CaOx肾结石的潜在的靶点(图2D)。不仅而且,钻研工人还实行了丁酸与CYP2C9的大分子嫁接,CYP2C9的四个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互不做用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在进行无线网络临床药理学分析预测CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶人类基因后,深入分析人数还进行体神经细胞研究确认了CYP2C9可缩减草酸诱导性的HK-2体神经细胞的ROS含量、炎症病变挫伤和凋亡。

图2| 大多据库联合技术研究预侧CYP2C9是丁酸影响于CaOx肾结石的靶染色体

设计最终

本深入分析1察觉丁酸在休外和内均能可以控制CaOx肾结石模式化的空气被氧化应激状态反应和支原体感染挤压伤,然后采用数据网上临床药理学学筛分拥有丁酸反应CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9,后面采用人体细胞系实验所得知CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2人体细胞系ROS的水平、支原体感染挤压伤和凋亡。许多察觉显示丁酸能够采用可以控制CYP2C9来可以控制CaOx肾结石的空气被氧化应激状态反应,避免支原体感染挤压伤。上述阶段中拜谱海洋怪物具备了数据网上临床药理学学技艺应用保障,凡此种种拜谱海洋怪物可升高熟进一步优化的表观遗传组学、淀粉酶质组学、基础代谢组学等多个学的产品及技艺应用保障,迎接拨打服务咨询! 考虑医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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