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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

老是作有机化工辅料而被遵守的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解代谢废料”称得上“藏宝图小氧分子”的心酸过程相仿,到最近近二十多年才被挖掘其核心的海洋植物学工作,从次“翻盘农奴把唱歌”,相当是在抗体慢性宫颈炎症性发病学习域内异彩纷呈。重复几篇论文题目宣传报道了在各式各样慢性宫颈炎症性发病的家禽整治中接受衣康酸或其化学式装饰衍海洋生物的开展益处,并挖掘其隐藏的靶点。关干衣康酸的“前世姻缘”与“这辈子”,详情软文《乳酸的逆转周围人——衣康酸!篇文章与你知道衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用表达球蛋白组学产品,实现1000+什么难以理解的度表达位点排除,可靠重新精典靶点,全多方面生信研究分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“显示”到“校验”全操作流程提供服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、工作标准流程

02、实测值信息

03、经“点”重演

在评测数据信息中,验出诸多学术论文中新闻报导的经典之作靶点和其衣康酸掩盖位点,如一、个被找到的衣康酸共价掩盖血清质KEAP1,都有糖酵解径路中的3个关键因素的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,同时炎性小体组成的血清质NLRP3和血细胞损伤的过程中的关键因素的血清质RIPK3等,其质谱图如下图表达图表达。

04、产品设备特色

1.多方面质控

商业性的化特喜欢的人探头孵育、SDS-PAGE判断、WB手机验证、样表涉及性深入分析等各八卦方位判断,狠抓品牌效果可靠的性。

2.性能卓越参数质谱器材游戏平台

在Orbitrap Astral全新一带高识别质谱仪提升下,实行衣康过酸突显位点及核蛋白鉴定结论新淬硬层,推动数学设计科学新发现。

3.全流量一坐式服务培训

针对拜谱生物体健全完善的调查品台,可出具“组织培养教育→电极孵育→WB检侧工具→什么难以理解的度衣康硝化作用淡化检侧工具→特权生信分折→特定的位点PRM确认”全注意事项提供服务,省时省劲更更省心。

05、浅析介绍(局部)

06、软件应用放向

PART 2、论文资料分享和交流

文章一

用英文怎么说大标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文主题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

调查项目:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

期刊论文二

英文翻译子标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名字版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探索游戏内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、案列延伸思维

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13体现了不弱的底物搭配学习能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱动物衣康酸性反应遮盖组实测值数剧中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应突显(以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

当做TCA循环系统中的中间的排泄物,衣康酸调整排泄、抗体和炎症病变病变能够 之间的能够 角色,为治疗方法方法抗体炎症病变病变性疾患作为了换用治疗方法方法策咯。衣康酸结构类型的中的亲电性α,β-不饱和点羧酸结构类型的能对球核苷酸上的亲水性半胱氨酸残基去烷基化呈现(迈克尔暴伤体现),该译文资料后呈现被分为“衣康酸呈现(itaconation)”,行而损害球核苷酸用途,控制抗体回话和排泄路径,为种疾患类药开发作为新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化表达核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医疗可以说参考值靶点代谢转化组(QMT1000)或卡路里排泄靶向治疗排泄组好产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

规范学术论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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